O objetivo do Congresso de Infectologia é educar a população jovem-médica, acadêmica e médica-residente em temas comuns pertinentes à infectologia necessários ao conhecimento do médico generalista, seja no âmbito primário, secundário ou terciário do serviço de saúde.

O congresso é realizado anualmente com o intento de manter o infectologista atualizado acerca das principais novidades científicas da infectologia.